인구의학연구소 조직은 소장,  운영위원회,  기관생명윤리심의위원회와 연구부서로는 생식의학연구부,  줄기세포연구부,  유전연구부,  생식보건정보의학연구부,  건강증진연구부로 구성되어 있으며 배아줄기세포주은행을 운영하고 있다.
조직도
인구의학연구소 운영위원
직책 성명 소속
운영위원장 (소장) 구승엽 의과대학 (산부인과)
운영위원 문신용 외부(5대 소장)
운영위원 전종관 외부(7대 소장)
운영위원 박상화 외부(IRB 위원)
운영위원 박중신 서울대학교병원 진료부원장
운영위원 김윤영 서울대학교병원 의생명연구원
운영위원 서창석 의과대학(산부인과)
운영위원 박교훈 의과대학(산부인과)
운영위원 이동섭 의과대학 (해부학)
운영위원 신충호 의과대학 (소아과)
운영위원 김성준 의과대학 (생리학)
운영위원 정경천 의과대학 (병리학)
운영위원 강건욱 의과대학 (핵의학)
운영위원 강현재 의과대학 (내과)
운영위원 강병철 의과대학 (중개의학)
운영위원 김훈 의과대학(산부인과)
운영위원  조희영 의과대학(산부인과)